Можно ли использовать "why she is here? " или это не правильно?

Правильно будет why is she here.
Потому что это вопрос, а когда мы что-то спрашиваем, то сначала вопросительное слово (why), затем глагол связка( is) и дальше как обычно

Специальные вопросы

who? – кто?
whom? – кого?
whose? - чей?
what? – что? какой?
which? – который?
when? – когда?
where? – где? куда?
why? – почему?
how? – как?
how much? – сколько?
how many? – сколько?
how long? – как долго? сколько времени?
how often? – как часто?

1) Специальные вопросы ко всем членам предложения, кроме подлежащего (и его определения) строятся так же, как и общие вопросы – посредством инверсии, когда вс или модальный глагол ставится перед подлежащим.
2) Специальные вопросы к подлежащему или к определению подлежащего – единственный тип вопросов, в которых не происходит инверсии и соблюдается прямой порядок слов ,характерный для повествовательного предложения.

Например:

Who will go the cinema today?
Кто сегодня пойдет в кино?

When will we go the cinema?
Когда мы пойдем в кино?

Where will we go today?
Куда мы сегодня пойдем?

Общий вопрос – это вопрос, требующий ответа "да" или "нет". В вопросах такого вида на первое место ставится вс глагол, после которого следует обычный порядок слов.

Например:
Are you from Brazil?
Вы из Бразилии?
Возможные ответы: Yes, I am. / No, I am not.

Did you meet Andy?
Вы видели Энди?
Возможные ответы: Yes, I did. / No, I did not.

Was she at home yesterday?
Она вчера была дома?
Возможные ответы: Yes, she was. / No, she was not.

 

Можно сделать вывод, что специальные вопросы задаются к любому члену предложения (кроме подл). А с общими вопросами по легче, можно посмотреть примеры.

 

- Схема; scheme
- Давать, выпускать; yield
- Промежуточный;intermediate
- Вызвать;
- Электрический импульс; electronic impulse
- Последовательность (таких) импульсов;  a sequence of such impulses
- Исходные данные; initial data
- Превращать слова в цифры;  converting words into figures
- Пробивать; punch
- Телетайпная лента; teletype ribbon
- Подавать, питать;fed 
- Электронно-счетная машина;  electronic calculating machine
- Молниеносная скорость; lightning speed
- Неограниченные возможности;  boundless possibilities.
- Наоборот; vice versa.
- Последовательность, порядок, ряд; sequence
- Для управления автоматизированным производством; automatic product control
- Умножение; multiplication
- Деление; division
- Пробивать цифры.figures are punched out