Что в этом предложении не так? : все области человеческой природы не только работают в согласии с логикой и последовательностью, но и с подлинной правдой и верой.

Все области человеческой природы  РАБОТАЮТ  не только в согласии с логикой и последовательностью, но и с подлинной правдой.Области работают а далее идёт двойной союз не только ,но и .Неверное построение предложения с двойным союзом

" Герой нашего  времени " - это роман,  " в котором отразился век и современный человек изображен довольно верно. " Главный его герой - Григорий Александрович Печорин,  личность глубокая, противоречивая и несчастная.  

Он - натура одаренная. Умен, может испытывать сильные страсти, может владеть собой. Печорин  верно судит о людях  и о себе. Характеристики, данные им его современникам,  правильны. Сердце Печорина бьется ровно, хотя " бешеные   порывы " одолевают героя. Григорий Александрович  хочет быть полезным людям, но почти всегда его попытки заканчиваются неудачей. Почему ?

Лермонтов считает Печорина " нравственным калекой ", ибо действует он противоречиво . Противоречие  -  и во внешности. Он не смеется, когда  на лице улыбка, походка небрежна,хотя и тверда,сложение - крепкое при нервической слабости. Максим Максимыч, добрый друг, замечает, что время от времени Печорин грустит, кутаясь в теплые вещи, хотя солнце за окном, а может и окно распахнуть , и на кабана сходить - и ни словом не обмолвиться о том, что было холодно.

" Целая моя жизнь была только цепь грустных  и неудачных противоречий  сердцу или рассудку", - так он думает о себе

И в чем это проявляется ? Во - первых, в его взгляде на мир. Ведь он живет " из любопытства", желая творить. Во- вторых, он не верит сам себе, потому что думает головою, а не чувствует при этом ничего. Сердце же у него - горячее понимать других, но...

Противоречия в характере героя  проявляется в отношении к  женщинам, их внимания он добивается из желания покорить, влюбить  и бросить. Так произошло и с Бэлой, и с Мэри.

Печорин - эгоист, но на  любовь до беспамятства он Не разбирая дороги, он поехал вслед за умирающей Верой, которая стала для него дороже  чести, жизни, счастья. Не догнав, Григорий Александрович  лег на траву и заплакал как ребенок. Потом разум возобладал, и душа " нравственного калеки" стала действовать по привычным законам.

Накануне дуэли Печорин думает о том,для какой цели он родился . Ведь он убивает Грушницкого, разрушает жизнь контрабандистов, избавляет от иллюзий Мэри, холодно общается с лучшим другом Максимом Максимычем. Поступки его мелки, что бы он ни писал у себя в дневнике. Печорин любит весь мир, а мир своего окружения не бережет. Потому и обречен.

Кто виноват  в  страшной судьбе героя, " умной ненужности" ? Воспитание ? Светское общество ?  Он сам ?  Почему Лермонтов назвал  Печорина героем своего времени ?

ответ лежит на поверхности. Время рождает своих героев и своих  не героев, в зависимости от  того, какие качества нужны или не нужны современному  обществу. И тогда человек не вписывается  в систему, оказывается ЛИШНИМ.   Умные, критично мыслящие не могли  найти себя, ибо   не нужны были  в тридцатые годы 19 века, когда приоритетным было молчание, а не  действие. Впрочем, Печорин и сам виноват, ибо каждый -  сам себе режиссер...

Хороший-отличный;плохой-скверный;большой-огромный;холод-мороз;тепло-жарко;размолвка-ссора.
Все эти слова являются синонимами ,то есть обозначают одно и то же ,но по - разному 
Эта разница заключается в оттенках значений ,в степени того или иного качества , признака,в сфере употребления ,в стилевой принадлежности  и т.д. 
Разберём конкретно :
хороший(нейтральное слово) - отличный ( эмоционально окрашенное - очень хороший ) .Степень качество признака во втором слове  сильнее .
плохой - нейтральное слово =нехороший ; скверный -  очень плохой ,мерзкий ( в словарях имеет помету - разговорный )То есть слова различаются стилевой принадлежностью.
большой - нейтральное ,общеупотребительное слово =значительных размеров ; огромный - очень большой ). Слова различаются степенью признака .
холод -это отсутствие тепла ; мороз - это лютый ,очень сильный холод .Слова различаются степенью признака. 
тепло - это нагретое состояние ;жарко - это - очень тепло .Слова различаются степенью признака. 
 размолвка-незначительное ухудшение отношений ;ссора - резкое ,порой ,длительное ,ухудшение взаимоотношений между людьми .Слова различаются степенью признака .