Где в природе можно обнаружить свободноживущих плоских червей?

Тип плоских червей живут в пресных и морских водоёмах, во влажной подстилке тропических лесов, ведут паразитический образ жизни.

Митохондрии — органеллы энергообеспечения метаболических процесов в клетке. Размеры их варьируют от 0,5 до 5-7 мкм, количество в клетке составляет от 50 до 1000 и более. В гиалоплазме митохондрии распределены обычно диффузно, однако в специализированных клетках сосредоточены в тех участках, где имеется наибольшая потребность в энергии. Например, в мышечных клетках и симпластах большие количества митохондрий сосредоточены вдоль рабочих элементов — сократительных фибрилл. В клетках, функции которых сопряжены с особо высокими энергозатратами, митохондрии образуют множественные контакты, объединяясь в сеть, или кластеры (кардиомиоциты и симпласты скелетной мышечной ткани).В клетке митохондрии выполняют функцию дыхания. Клеточное дыхание — это последовательность реакций, с которых клетка использует энергию связей органических молекул для синтеза макроэргических соединений типа АТФ. Образующиеся внутри митохондрии молекулы АТФ переносятся наружу, обмениваясь на молекулы АДФ, находящиеся вне митохондрии. В живой клетке митохондрии могут передвигаться с элементов цитоскелета.

Хлоропласты лишь сходны в одном - они отвечают за пигмент.
Световая фаза заканчивается образованием кислорода водорода и углекислого газа, что в дальнейшем расходуется на образование в ночной фазе глюкозы.
На счет хромосом, сам смысл вопросы не понял.
За пределы клетки транспортируются вещества обмена веществ(чаще всего это уже переработанные вещества, которые в дальнейшем не используются).
На счет генитического кода я скажу одно : все гены кодируются в хромосомах, в виду определенных нуклеотидов, и с ДНК и РНК эта информация передается.